Lana och Lilly Wachowski som skrivit och producerat The Matrix-trilogin har konfirmerat i en intervju att den handlar om upplevelsen att vara transperson. I en intervju med Netflix Film Club bekräftar Lilly Wachowski att de teorier som under några år florerat.

– Jag är glad över att det kommit fram att det var intentionen med filmen från början. Världen var inte riktigt redo för det då. Jag är glad att folk pratar om The Matrix och dess transberättelse.

Filmerna gjordes mellan 1999 och 2003. Då hade ingen av systrarna ännu kommit ut som trans, men rykten om att filmen skulle vara skriven som en metafor om upplevelsen att vara trans, hade redan börjat spridas. De handlade bland annat om huvudpersonens dubbelliv som Neo/Mr Anderson. Att det röda pillet han blir erbjuden skulle vara östrogenpiller och att Matrix-världen i relation till den ”vanliga” världen handlar om könsdysfori.
Om just dessa rykten stämmer har ingen av systrarna konfirmerat.